I skjeden finnes det mange bakterier som utgjør vår normalflora. Det er flest melkesyrebakterier som gjør miljøet litt surt.
Endringer av sammensetningen av bakterier i skjeden kan gjøre at pH blir høyere. Dette vil ofte påvirke utfloden som kan lukte mer. Bakteriell vaginose er plagsomt, men ikke farlig, og går ofte bort av seg selv.